遗传密码退化性的理解与蛋白质家族分类的新方法：数学途径
摘要：遗传密码是指遗传物质（DNA或RNA序列）中所编码的信息如何由活性细胞转化成蛋白质（氨基酸序列）的一套规则。该密码定义了三核苷酸序列（称为密码子）和氨基酸之间的映射关系。由于存在20种氨基酸和64种可能的三核苷酸序列，因此64个三联体中的一个以上可能编码为一个氨基酸，这导致了退化性问题。本文从数学角度使用一个名为“Impression”的参数来解释遗传密码的退化逻辑。蛋白质家族的分类也是生物化学和基因组学领域中一直存在的问题。属于同一类的蛋白质具有一些相似的生物化学性质，这对于新药设计非常重要。利用参数“Impression”和图论特性，我们还开发了一种新的蛋白质家族分类方法。
作者：Jayanta Kumar Das, Atrayee Majumder, Pabitra Pal Choudhury
论文ID：1512.00745
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2015-12-03