流感病毒内体逃脱的随机模型

摘要:流感病毒在结合细胞表面后通过内吞作用进入细胞。在内体旅程中,酸化引发了病毒尖刺蛋白血凝素(HA)的构象变化,导致病毒基因组从内体逃逸到细胞质。对于HA介导的与内体融合过程的定量理解仍然缺乏。我们在这里发展了一个随机模型,以估计内体纳米域内HA构象的变化。利用马尔可夫跳跃过程来对质子到达HA结合位点进行建模,我们计算了它们累积和激活HA所需的平均首次时间。该分析显示HA质子结合位点具有较高的化学能垒,可保证尖刺蛋白在亚酸性pH下的稳定性。最后,我们预测激活超过3个相邻的HA是必要的,以防止过早的融合。

作者:Thibault Lagache, Christian Sieben, Tim Meyer, Andreas Herrmann, David Holcman

论文ID:1510.06382

分类:Subcellular Processes

分类简称:q-bio.SC

提交时间:2015-10-22

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