人类基因组的统一理论揭示了间期细胞核中受限的空间染色体排列
摘要：人核中46个染色体（46,XY）呈密集且非随机排列。我们在这里通过将基因组中所有染色体对的内在参数（染色体长度和基因数）统一，推导出一种外在参数称为有效基因密度，从而模拟系统级染色体相互作用。在有效基因密度空间中的分层聚类和潜在退化揭示了染色体簇的空间排列的系统级约束，这些约束之前是未知的。我们的发现证实了纤维母细胞和淋巴细胞系中染色体空间排列的实验数据，从而证明了人类基因组对染色体排列的约束。我们提出这一无需额外实验输入的统一理论可以扩展到其他具有已注释基因组的真核生物物种，以推断它们受约束的自组织染色体空间排列。
作者：Sarosh N. Fatakia, Ishita S. Mehta, Basuthkar J. Rao
论文ID：1509.08074
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2017-11-09