糖皮质激素受体进化中的功能变异与模式耦合的相关性
摘要:蛋白质动力学中的非线性效应被认为在功能,特别是异构性功能中起着作用,通过促进振动模式之间的能量转移。最近提出的一种方法专注于接近平衡状态下人口非高斯形状,将这些信息投射到实空间中,以确定与功能相关的氨基酸。我们在这里将这种方法应用于糖皮质激素受体(GR)家族中的三个祖先蛋白质,并表明限制GR进化过程中功能活性的突变与非线性贡献突变到接近原生构型分布的位置之间有显著相关性。我们的发现表明,非线性效应不仅对于理解蛋白质功能不可或缺,而且还可以被用作功能位点确定的预测工具。
作者:B. Kav, M. Ozturk and A. Kabakcioglu
论文ID:1509.05483
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2022-03-23