2013-4年的疫苗逃逸与A/H3N2病毒的糖蛋白水路径进化
摘要：2007年广泛出现了更致病的甲型H1N1亚型流感病毒株，2011年出现了更致病的H3N2亚型流感病毒株，尤其是在2013-2014年，H3N2疫苗的效果几乎降低到零。通过序列比对和计算位点的同一性和相似性，嗜酸性细胞膜糖苷酶与以前的低致病菌株之间的氨基酸差异似乎很小(<1%)。在这里，我们展示了分析与嗜酸性细胞膜糖苷酶球形紧实性和模块化有关的分形疏水力，可以量化增加致病性的突变起源。它还可以预测疫苗逃逸，并指定了与世界卫生组织目标不同的2015年H3N2疫苗的优化靶点。与一些基于血凝素抗原漂移和貂血清的早期方法相比，这些新方法及时完成，只需几天时间，只使用NCBI和GISAID的氨基酸序列。
作者：J. C. Phillips
论文ID：1508.07244
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2016-04-20