XL-mHG检验用于富集:技术报告

摘要:最小超几何检验(mHG)是一种强大的非参数假设检验,用于检测分类二进制列表中的富集。在这里,我提供了对其定义的详细回顾,以及用于实现的算法,这些算法可以高效计算精确的p值。然后,我介绍了mHG的一个推广,称为XL-mHG,它提供了对测试富集类型的额外控制,并描述了计算其检验统计量和p值所需的精确算法修改。XL-mHG算法是GO-PCA的一个构建模块,GO-PCA是一种最近提出的利用先验知识进行基因表达数据的探索性分析的方法。

作者:Florian Wagner

论文ID:1507.07905

分类:Other Statistics

分类简称:stat.OT

提交时间:2015-09-25

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