序列异质性加速蛋白质在DNA上的目标搜索
摘要：DNA序列对特定结合位点进行蛋白质搜索的过程非常重要，因为它标志着所有重要生物过程的开始。我们提出了一个理论研究，探索了DNA序列对蛋白质搜索动力学中的对称性、异质性和化学组成的作用。使用离散状态随机方法和一次通过事件分析，考虑了最相关的物理化学过程，获得了对搜索动力学的完全分析描述。结果发现，与现有观点相反，蛋白质在具有更多异质序列的DNA上通常搜索速度更快。此外，搜索动力学可能受到靠近目标位点的化学组成的影响。讨论了这些现象的物理起源。我们的结果表明，通过修改基因组的化学组成、对称性和异质性可能有效地调节生物过程。
作者：Alexey A. Shvets and Anatoly B. Kolomeisky
论文ID：1507.06004
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2016-01-20