使用PETSc-DMPlex在Firedrake中的高效网格管理
摘要：使用可组合的抽象可以将新的和成熟的算法应用于各种问题，同时自动继承众所周知的性能优化的好处。这项工作重点介绍了将PETSc DMPlex领域拓扑抽象与Firedrake自动有限元系统组合起来，从而创建出一种结合了表达能力、灵活性和高性能的PDE求解环境。我们描述了Firedrake如何利用DMPlex来提供有限元装配所需的间接映射，同时支持各种网格输入格式和运行时域分解。特别是，我们描述了DMPlex及其相应的数据结构如何允许通用的用户定义离散化，并利用数据布局优化来提高缓存一致性，并确保装配计算过程中的重叠通信。
作者：Michael Lange, Lawrence Mitchell, Matthew G. Knepley, Gerard J. Gorman
论文ID：1506.07749
分类：Mathematical Software
分类简称：cs.MS
提交时间：2016-11-01