双物种带有附着和脱附的TASEP的平均场分析
摘要：细胞中，大多数货物都是由马达蛋白沿着微管进行运输的。从生物物理学角度来看，许多马达蛋白沿着单一轨道的单向运动可以用全异质简单排斥过程（TASEP）来描述。从中可以得到许多有意义的性质，例如域壁（定义为沿运动轨迹高密度和低密度马达蛋白之间的边界）和边界层的出现。然而，显然在一个轨道上可能存在不同的马达蛋白。因此，基于单一粒子种类的TASEP的先前研究并不足以找到更详细的马达蛋白沿单一轨道运动的性质。为解决这个问题，本研究讨论了具有两种粒子种类的TASEP。提供了获得每种粒子种类密度的理论方法。利用这些方法，获得了与相变有关的粒子密度的性质。我们的分析显示，单一种类密度的域壁和边界层总是与总粒子密度的那些同时出现。总粒子密度的域壁高度等于单一种类的域壁高度的求和。还提供了典型模型参数的相图。本研究提供的方法可以推广到分析具有更多粒子种类的TASEP。
作者：Minghua Song and Yunxin Zhang
论文ID：1503.01555
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2015-03-06