生物系统中的测量:从自组织视角出发
摘要:生物系统的测量成为关注的话题,是由于大量关于实验结果有限的重复性的报告。为了揭示这种不一致性的根源,我们研究了生物系统作为远离化学平衡的动态系统的普遍特征,而且在大多数情况下也远离它们的Lyapunov稳定状态。因此,在生物实验中,我们观察不到状态,而是观察所研究生物体所遵循的不同轨迹。如果选择了其中一种可能的序列,就可以得到整个问题的一小部分,有时以看似高度重复的方式。但是只有在了解到所有可能的轨迹的情况下,我们才知道生物体的状态。而这通常是不可能的。因此,我们提出了一个不同的框架,用于报告和分析生物实验,以尊重非线性数学的观点。这个观点应该用来避免过于乐观的结果,这些结果必须被撤回或严重补充。增加实验程序的规范性是更好地理解生物系统可能演变的路径范围的方式,而这些路径隐藏在实验方案的演化中。
作者:Dalibor v{S}tys, Jan Urban, Renata Rycht''arikov''a, Anna Zhyrova and Petr C''isav{r}
论文ID:1502.02419
分类:Other Quantitative Biology
分类简称:q-bio.OT
提交时间:2017-04-03