非均匀DNA复制动力学的数值建模
摘要:DNA复制是一个复杂的过程,涉及到许多因素,包括复制因子的启动速率和叉速度。这些因素在空间和时间上都可能发生变化。本文提出一种计算技术,用于模拟不均匀的DNA复制动力学。我们可以利用这个模型来模拟分子梳技术获取的数据集,该技术是探测复制过程的一种广泛使用的实验方法。我们还可以通过将模型拟合到实验数据集来推断复制程序的信息,并通过将模型拟合到模拟数据集来测试计划实验的有效性。我们考虑了异步数据集,并说明了缺乏同步对复制特征的影响。除了分子梳技术,我们的技术还适用于基于微阵列的复制研究。
作者:Michel G. Gauthier, Antoine Dub''e, and John Bechhoefer
论文ID:1408.5216
分类:Quantitative Methods
分类简称:q-bio.QM
提交时间:2014-08-25