Drosophila melanogaster群体中的修订注释、性别偏向表达和谱系特异基因
摘要：修订的D. ananassae、D. yakuba和D. simulans的基因模型，包括UTR和经验证的内含子-外显子边界，以及使用模糊互补最佳命中的blast比较鉴定的同源基因组。利用这些修订的注释，我们使用cufflinks套件进行差异表达测试，以提供生殖组织和残骸之间差异表达的广泛概述。我们在D. yakuba和D. simulans的组织中鉴定了数千个差异表达的基因，其中约60\%的同源基因在D. yakuba和D. simulans中表达模式一致。我们鉴定了几种可能的多基因组转录本，指示基因组中的转录顺序通过以及不同分类群之间可能的基因融合和裂变事件的组合。此外，我们还在每个物种中鉴定了数百个物系特异基因，这些基因在任何其他果蝇物种的转录本中都没有blast命中，它们是新功能蛋白质和潜在遗传变异的潜在来源。
作者：Rebekah L. Rogers, Ling Shao, Jaleal S. Sanjak, Peter Andolfatto, and Kevin R. Thornton
论文ID：1408.0247
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2014-10-03