评估外部掺入RNA对照比例混合物在差异基因表达实验中的技术性能
摘要：基因组规模的差异基因表达实验的技术性能评估，报告和比较需要标准方法。我们使用从分析外部携带定量丰度比的内插转录物控制比混合物得出的衡量标准仪表板来评估技术性能。这些具有定义的丰度比的控制比混合物可以评估差异表达转录物列表的诊断性能，比值检出限（LODR）估计以及表达比变异性和测量偏倚。性能指标套件适用于典型实验的分析，并且我们还将这些指标应用于评估实验室之间的技术性能。在12个实验室之间使用相同样品的一个实验室间研究展示了11个实验室通常具有一致的诊断能力。对于相同的测量过程，测量比值的可变性和偏倚在实验室之间也是可比的。对使用不同mRNA富集协议的测量过程观察到了不同的偏倚。
作者：Sarah A. Munro, Steve P. Lund, P. Scott Pine, Hans Binder, Djork-Arn''e Clevert, Ana Conesa, Joaquin Dopazo, Mario Fasold, Sepp Hochreiter, Huixiao Hong, Nederah Jafari, David P. Kreil, Pawe{l} P. {L}abaj, Sheng Li, Yang Liao, Simon Lin, Joseph Meehan, Christopher E. Mason, Javier Santoyo, Robert A. Setterquist, Leming Shi, Wei Shi, Gordon K. Smyth, Nancy Stralis-Pavese, Zhenqiang Su, Weida Tong, Charles Wang, Jian Wang, Joshua Xu, Zhan Ye, Yong Yang, Ying Yu, Marc Salit
论文ID：1406.4893
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2014-10-16