3DNA:一种用于DNA雕塑的工具

摘要:DNA自组装是一种稳健且可编程的方法,用于在纳米尺度上构建结构。世界各地的研究人员已经提出并实施了不同的技术来构建二维和三维纳米结构。其中一种技术涉及使用DNA Bricks(Ke等人,2012年提出的一种方法)来创建复杂的三维结构。对这些DNA纳米结构进行建模可能是一项繁琐且费时的任务。利用碱基配对的可编程性来产生自组装的定制形状,我们提出了一个名为3DNA的软件套件,用于建模、编辑和可视化这种复杂的结构。3DNA是一个开源软件,通过DNA Bricks的简单模块化自组装工作,提供了一种更直观、更好的构建三维形状的方法。除了通过简单的图形用户界面进行建模和预想形状外,3DNA还支持集成的随机序列生成器,生成对应于设计模型的DNA序列。该软件可在www.guptalab.org/3dna上获取。

作者:Shikhar Kumar Gupta, Foram Joshi, Dixita Limbachiya and Manish K Gupta

论文ID:1405.4118

分类:Emerging Technologies

分类简称:cs.ET

提交时间:2014-05-19

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