细胞发展遵循最大费歇信息
摘要:优化了真核细胞的发育,以遵守最大的胞内信使蛋白质通量。这反过来意味着关于目标核孔复合物(NPR)的角位置的最大费舍尔信息。该细胞被简单地建模为球形,细胞膜(CM)直径为10微米,同心的核膜(NM)直径为6微米。NM包含大约3000个核孔复合物(NPC)。发育需要信使配体从CM-NPC-DNA目标结合位点传播。通过磷酸化,配体获得负电荷,通过牛顿轨迹穿过细胞质朝着带正电荷的NPC(利用正核定位序列)。CM-NPC通道在NPC处遵循最大化的平均蛋白质通量F和费舍尔信息I,具有一阶delta I = 0和近似二阶delta I = 0对环境扰动的稳定性。它的许多预测得到了确认,包括1-4个蛋白质的蛋白质通路的主导地位,EGFR蛋白质的4nm尺寸以及近似通量值F =10^16 proteins/m2-s。进入细胞核后,每个蛋白质最终将其配体信息传递给具有最大概率(即最大库尔巴克-利布勒熵HKL)的DNA靶点位点。在光滑度极限下,HKL趋近于IDNA/2,使得整个CM-NPC-DNA通道符合最大费舍尔I。因此,最大信息接近非平衡,这是生命的一个条件。
作者:B.R. Frieden and R.A. Gatenby
论文ID:1404.7529
分类:Subcellular Processes
分类简称:q-bio.SC
提交时间:2014-05-01