评估T细胞克隆大小分布：一种非参数方法
摘要：人类外周T细胞库的克隆结构受到多种体内稳态机制的影响，包括抗原呈递、细胞因子和细胞调控等。准确的调节能够使其具有出色的抵抗各种病原体的能力，而系统性的故障可能导致严重后果，如自身免疫性疾病。在这里，我们开发并利用一种非参数统计方法来评估最新的下一代测序数据中的T细胞克隆大小分布。对于41个健康个体和一名接受治疗的强直性脊柱炎患者，我们始终发现在几个数量级上存在冪律缩放，并首次定量计算出衰减指数的意义值。在健康的捐赠者中，这个指数被证明是相似的，在治疗前对于自身免疫患者来说则明显不同，并在治疗后趋于典型值。我们讨论了这些发现对于适应性免疫的理论理解和数学建模的影响。
作者：O.V. Bolkhovskaya, D.Yu. Zorin, M.V. Ivanchenko
论文ID：1404.6790
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2014-10-07