蛋白质组学对生物学推断的影响：在解释蛋白质组学数据时经常被忽视的问题——功能验证的恳请
摘要：蛋白质组学在2014年迎来了它的20周年。在这相对较短的时间内，它已经渗透到生物学的大部分领域，并且在未来可能会继续扩展。这两个十年见证了蛋白质鉴定和表征的速度和敏感性的显著提高，即使是从复杂样品中也能够实现。事实上，二十年前的挑战现在已经变成了日常例行事务。虽然技术上的挑战还没有完全结束，但现在面临的挑战是蛋白质组数据的最佳评估和利用，以从生物学角度得出最佳结论。本文所提出的观点是蛋白质组数据几乎总是不完整的。这反过来意味着虽然比mRNA水平更好，但蛋白质水平通常无法从生物学角度得出有效的结论，特别是在翻译后修饰在其中起重要作用的情况下。这又意味着将蛋白质组数据转化为生物学数据需要一个重要的中间层，即不仅仅是通过其他方法确认蛋白质丰度变化，而且要对蛋白质组筛选结果中突出的蛋白质水平变化的生物学后果进行功能评估。
作者：Thierry Rabilloud (LCBM - UMR 5249), Pierre Lescuyer
论文ID：1403.5414
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2014-03-24