酵母中翻译的遗传影响
摘要：遗传差异导致的基因表达差异是表型变异的重要来源。遗传变异对蛋白质水平和mRNA水平的影响程度之间的相似性仍然存在争议。本研究利用核糖体剖面法研究了两个酿酒酵母菌株之间的遗传差异如何影响翻译过程，发现这两个株系之间有数百个基因的翻译存在差异。通过两个株系的二倍体杂交测量表明，对于翻译过程来说，与mRNA水平相比，存在大约一半的顺式作用效应。无论是在父本还是在杂交后代中，大多数对翻译的影响都是微小的，通常一个mRNA差异会在足迹差异中得到一致的反映。cis-和trans-元素在足迹差异水平上的相对重要性与mRNA差异的情况类似。在足迹差异方面，翻译过程引起的差别比预期要大。这与报道的酿酒酵母菌种间翻译差异相反，后者更常出现与mRNA差异相反而不是增强的情况。最后，我们列举了这两个酵母菌株中的早期终止翻译情况，并发现一些错误的参考基因注释导致了明显的无义突变，这些突变实际上位于被翻译基因区域之外。总体而言，遗传因素在翻译过程中对基因表达差异起到了微妙的调节作用，并且翻译过程不会在基因表达水平的遗传影响之间引起明显差异。
作者：Frank W. Albert, Dale Muzzey, Jonathan Weissman, Leonid Kruglyak
论文ID：1403.3449
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2014-09-04