DNA序列的超复数互相关

摘要:DNA的超复数表示法用于便于比较具有模糊组成的DNA序列。利用超复数表示法,扩展和改进了传统的序列分析方法,如点阵分析、动态规划和互相关方法,以对齐具有模糊组成的DNA序列。超复数点阵分析可以提供更多对所需对齐程度的控制。提出了一种适应DNA的超复数表示法的新评分系统,并与动态规划对齐方法相结合。通过使用超复数互相关,将两个对齐的DNA序列之间的匹配和不匹配的对齐信息分别存储在结果的实部和虚部中。不匹配的对齐信息特别有助于改进基于一致序列的模体扫描。

作者:Jian-Jun Shu and Yajing Li

论文ID:1402.5341

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2023-08-03

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