交叉表型元分析揭示了调控转录协同模式的大规模跨基因表达定量性状连锁位点(trans-eQTLs)。

摘要:基因调控的遗传变异是个体间表型差异的主要驱动因素,可以用来揭示细胞内的生物过程是如何组织起来的。尽管检测顺式eQTLs现在已经变得常规化,但由于解释方差较小且需要对数百万个SNP进行数千个转录本的关联测试,寻找翻式eQTLs仍然具有挑战性。在这里,我们成功地使用了一种补充方法来寻找与多个基因表达相关的SNP,以绘制翻式eQTLs的地图。我们发现了732个在两个大陆人群中复制的翻式eQTLs;每个翻式eQTL控制着大量的目标转录本(调控子),这些转录本是由转录因子控制的相互作用网络的一部分。因此,我们能够揭示共调节基因集,并开始描述基因调控的细胞电路。

作者:Boel Brynedal, Towfique Raj, Barbara E Stranger, Robert Bjornson, Benjamin M Neale, Benjamin F Voight, Chris Cotsapas

论文ID:1402.1728

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2014-02-10

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