聚类算法CONCOCT的完整论文标题翻译如下：基于覆盖度和组成的连续片段聚类
摘要：通过元基因组学，可以在复杂的微生物群落中重建微生物基因组，而无需进行培养。由于组装通常会导致基因组碎片化，将属于同一基因组的基因组碎片（contigs）分组，即称为binning，仍然是一个主要的信息学挑战。在这里，我们介绍了CONCOCT，这是一个计算机程序，结合了三种类型的信息 - 序列组成，多个样品覆盖度和读取对链路 - 以自动将contigs划分为基因组。我们展示了该程序在人工和真实人体肠道元基因组数据集上的高召回率和精确率。
作者：Johannes Alneberg, Brynjar Smari Bjarnason, Ino de Bruijn, Melanie Schirmer, Joshua Quick, Umer Z. Ijaz, Nicholas J. Loman, Anders F. Andersson, Christopher Quince
论文ID：1312.4038
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2013-12-17