拟南芥中减数分裂交叉和基因转化的基因组景观
摘要：准确了解凯特幂的分布是理解许多与种群遗传学和进化相关的方面所必需的，从单体型结构和远距离遗传连锁到新等位基因的产生。为了达到这个目的，我们重新测序了13个凯特四倍体的四个产物以及来自拟南芥杂种的10个加倍单倍体。通过短读取检测GC先前由基因组重排所混淆。对于错位读取进行严格过滤使得GC可以高精度鉴定，并揭示了一个约80 kb的转座子，通过凯特幂重组介导的拷贝数变化进行。非杂交相关的GC非常罕见，这很可能是由于它们平均长度约为25-50 bp，明显短于与凯特幂相关的GC的长度。总的来说，重组优选地靶向非甲基化的核小体自由区域，这些区域显示了两个序列模体的显著富集。
作者：Erik Wijnker, Geo Velikkakam James, Jia Ding, Frank Becker, Jonas R. Klasen, Vimal Rawat, Beth A. Rowan, Daniel F. de Jong, C. Bastiaan de Snoo, Luis Zapata, Bruno Huettel, Hans de Jong, Stephan Ossowski, Detlef Weigel, Maarten Koornneef, Joost J.B. Keurentjes and Korbinian Schneeberger
论文ID：1311.3236
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2013-11-14