Progenetix：12年的肿瘤基因组数据整理
摘要：DNA拷贝数异常（CNAs）可在大多数癌症基因组中找到，对于理解肿瘤起始和进展的潜在机制至关重要。自2001年首次发布以来，Progenetix项目（http://www.progenetix.org）提供了一个专门的参考资源，旨在提供最全面的全基因组CNAs数据集合。随着比较基因组杂交（CGH）技术应用于数以万计的癌症基因组，过去12年间，我们的数据整理工作使Progenetix呈现的癌症样本数量增加了60多倍。此外，添加了新的数据探索工具和可视化选项。特别是，基因特异性CNAs频率分析将有助于将癌症基因与相关癌症类型相关联。此外，新的用户文件处理接口使用户能够利用在线工具，包括用于专利数据预出版的各种数据表示选项。在这篇更新文章中，我们报告了数据库在内容、用户界面和在线工具方面的最新改进。
作者：Haoyang Cai, Nitin Kumar, Ni Ai, Saumya Gupta, Prisni Rath and Michael Baudis
论文ID：1311.2757
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2013-11-13