细胞决策偏差:细胞功能多样性中缺失的要素

摘要:细胞的功能多样性是生物过程展开的重要决定因素。大多数关于多样性的描述都涉及寻找序列或表达差异。也许还有更微妙的机制在起作用。使用信息处理和决策制定的隐喻可能会更清楚地展示这些细微差别。将适应性和转化过程(如细胞重编程)理解为一系列简单决策,使我们可以使用细胞信号检测理论(Cell SDT)来检测可能偏向于一种结果的机制中的潜在偏见。我们可以将检测细胞重编程偏见的方法应用于细胞重编程和其他复杂的分子过程。为了展示该方法的范围,我们将对重编程为肌纤维和神经元表型的细胞表型之间的差异进行批判性的检验。在表型偏见的特征是隐晦的情况下,基因组偏见(预存在和诱导)的特征可能提供一种替代方法。这些替代方法的检验将使用一系列纤维细胞系在细胞重编程之前(预存在)和药物处理后的个别基因细胞RNA的差异进行探索。总之,将讨论这种方法和相关类比的有用性和局限性。

作者:Bradly Alicea

论文ID:1310.8268

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2013-11-05

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