基于基因表达的生物标志物指示植物在受控和自然环境中的水分状况。

摘要:基于转录组响应水分亏缺的表达模式,我们使用向日葵(Helianthus annuus L.)作为模式物种,在温室和田间条件下研究了对水分亏缺的转录组响应。在控制条件下,我们特别鉴定了三个基因的表达模式与植物水分状况高度相关,其水分状况通过黎明前叶片水势、可蒸腾土壤水分比例、土壤含水量或总土壤水分比例估算。我们建立了一个广义线性模型,根据控制条件下三个所选基因的表达水平,估计这些经典的水分状况指标。这种估计与四个不同的基因型和植物的生长阶段(开花前或开花后)无关。在三个不同试验中,我们进一步验证了这种基因表达生物标记在田间条件下对四个基因型在大范围水分状况下的适用性,并能够校正一天中大范围采样期间的表达值。

作者:Gwena"elle Marchand, Baptiste Mayjonade, Didier Var`es, Nicolas Blanchet, Marie-Claude Boniface, Pierre Maury, Fety Andrianasolo Nambinina, Philippe Burger, Philippe Debaeke, Pierre Casadebaig, Patrick Vincourt, Nicolas B. Langlade

论文ID:1310.2542

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2013-10-10

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