更快的质量分解
摘要：代谢组学是对生物体的基因组、转录组和蛋白质组研究的补充。今天，大部分代谢物仍然是未知的，尤其是对于非模式生物而言。质谱是分析代谢物等小分子的主要技术之一。确定小分子的分子式是识别其的基本步骤。 在这里，我们提出并评估了三种加速分子式确定的算法工程技术。为此，我们修改了现有算法，用于分解分子的单同位素质量。这些技术使运行时间减少了四倍，并将内存消耗减少了高达94％。与传统的搜索树算法相比，我们的算法实现了1000倍的加速。
作者：Kai D"uhrkop, Marcus Ludwig, Marvin Meusel, Sebastian B"ocker
论文ID：1307.7805
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2013-07-31