细菌基因组中的共线性：推断、组织与演化
摘要：基因并不是随机分布在基因组中的。类同性（synteny）是指不同物种基因组中相对位置的保守性，反映了自然进化的基本约束。我们提出了一种从多个基因组中推断共定位基因对的方法，描述它们的组织，并研究它们的进化历史。因此，在细菌基因组中，我们确定了类同体（syntons），它们是包含和扩展操纵子的相邻基因的簇。这些类同体的大小分布将它们分为大的类同体，对应于细菌的基本巨大分子复合物，和较小的类同体，展现出显著的指数大小分布。这种分布在两个方面是“通用的”：它适用于非常不同的基因组，也适用于功能上不同的基因。类似的统计规律在以前的细菌基因组研究中已经报道过，并且通常归因于纯化选择或中性过程。在这里，我们根据简约性的概念进行了新的分析，并发现形成小类同体的主要进化机制是基因聚集的选择性过程。总的来说，我们的结果表明，有一个共同的进化过程在选择性地塑造了细菌基因组的组织和多样性。
作者：Ivan Junier and Olivier Rivoire
论文ID：1307.4291
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2013-07-17