不同意,一些讽刺,令人失望的科学实践及对改进的呼吁:回应《TMM在microRNA-Seq上的差劲表现》

摘要:《对TMM在microRNA-Seq上的低性能的回应》:对Garmire和Subramaniam的《Divergent Views》文章的回应。该文章回应了我们的《miRNA-seq normalization comparisons need improvement》文章(Zhou等人,2013)。我们使用可复现的代码示例展示了他们错误地使用了我们的归一化方法,并强调了他们研究中的其他问题。我希望在这里揭穿GS在他们的回应中提出的几个不真实或误导性的陈述。与GS不同,我的观点得到了R代码、引用和电子邮件往来的支持。最后,我呼吁更好的实践。

作者:Mark D. Robinson

论文ID:1305.6202

分类:Other Quantitative Biology

分类简称:q-bio.OT

提交时间:2013-06-11

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