HIV RNA结构在重组和种系分化中的作用：在嘌呤A中驰骋，避开HTLV
摘要：人类免疫缺陷病毒（HIV-1）RNA基因中嘌呤A的极度富集与大多数生物RNA中轻度的嘌呤加载并行。这应该阻碍了病毒基因组与宿主RNA之间的环环相连作用，这种相连作用可以生成足以触发细胞内报警的双链RNA片段。然而，有潜力侵入同一宿主细胞的人类T细胞白血病病毒（HTLV-1）在嘧啶C上显示出极度富集。假设低GC\%的HIV和高GC\%的HTLV-1共享一个共同的祖先，可推测GC\%的差异是为了防止这些不断出现的慢病毒种之间的同源重组。通过这种细胞内生殖障碍而隔离，原型HIV-1占据了低GC\%的优势地位（因此致力于嘌呤A而不是嘌呤G）。原型HTLV-1放弃了这个优势，演化出了一种独立的演化策略。自上世纪90年代提出以来，支持这一假设的证据越来越多。在编码蛋白质和核酸结构之间需要准确平衡的冲突中，通常会偏向于核酸，因为除了调控作用外，结构对于重组至关重要。然而，在序列差异阈值以上，结构（因而也是重组）就会受到损害。新物种随之产生。
作者：Donald R. Forsdyke
论文ID：1305.2132
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2014-06-05