不完美电子显微图像的自动对齐用于神经重建
摘要:从动物中重建神经回路的最常用方法是将组织切割得非常薄,然后拍摄电子显微镜(EM)图像的马赛克。为了追踪不同图片和不同切片上的神经元,在同一切片中的其他图像之间以及上下切片之间,这些图像必须精确对齐。不幸的是,切片和成像过程并不理想——导致对齐困难的一些问题包括透镜畸变、成像过程中的组织收缩、切割组织中的撕裂和褶皱,以及灰尘和其他伪影。此外,数据集非常大(数十万张图像),每个图像必须与许多邻居对齐,因此该过程必须自动化且可靠。本文讨论了处理这些问题的方法,并提供数值结果描述所得到的对齐的准确性。
作者:Louis K. Scheffer, Bill Karsh, Shiv Vitaladevun
论文ID:1304.6034
分类:Quantitative Methods
分类简称:q-bio.QM
提交时间:2013-04-23