eQTL映射、遗传度估计和多基因模型的融合：双相情感障碍风险变异的新兴光谱
摘要：孤独症谱系障碍（ASD）和其他神经精神疾病的遗传成分相当重要。最近的研究努力集中在理解疾病易感性的遗传基础上，基因组关联研究（GWAS）揭示了一些有希望的关联结果。然而，孤独症的遗传病因仍然不清楚，大规模GWAS鉴定的特定基因变体尚无法解释遗传性的大部分（根据孪生和家族研究估计为80％）。此外，与发现相比，关联位点的功能理解通常落后。我们报告的研究表明，在孤独症易感性的遗传机制上，GWAS仍有很大的提升空间，疾病风险的很大一部分变异可能通过整合功能基因组学方法来发现。我们结合了最新的遗传性估计和多基因建模的分析进展，并利用最新的生物学数据生成技术来评估不易处理的疾病的功能类遗传变异的贡献性质和规模。我们在小脑和顶叶皮层的cis eQTLs中发现，这些变异捕获了通过GWAS进行检查的SNP的总遗传病异质性的一半以上，并且显示了eQTL基因遗传性估计高度依赖于组织。我们的发现表明，可以获得比目前报告的更高分辨率，以确定捕获疾病风险很大一部分遗传病因的共同位点的数量，并且贡献位点的功能性质可以当作整体进行澄清。
作者：Eric R. Gamazon, Hae Kyung Im, Chunyu Liu, Members of the Bipolar Disorder Genome Study (BiGS) Consortium, Dan L. Nicolae, Nancy J. Cox
论文ID：1303.6227
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2013-04-01