利用蛋白质结构识别非随机体细胞突变的图论方法
摘要：通过图论方法，结合蛋白质三维结构，提出了一种新的方法来识别突变聚类。使用这种方法，可以探测到已知存在突变聚类的蛋白质中的新聚类，并在现有方法未能发现的蛋白质中识别出聚类。通过结合蛋白质数据库中的空间信息和 Catalogue of Somatic Mutations in Cancer （COSMIC）中的突变数据，可以在已知的癌基因如 EGFR 和 KRAS 中识别新的突变聚类。此外，通过应用图论来考虑三维结构，还可以在 DPP4、NRP1 和其他蛋白质中识别聚类。
作者：Gregory Ryslik and Yuwei Cheng and Kei-Hoi Cheung and Yorgo Modis and Hongyu Zhao
论文ID：1303.5889
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2013-07-16