遗传密码的稳定性和氨基酸的最佳参数
摘要：遗传密码的标准结构在最小化错误解读和单点突变的不利影响方面比具有相同结构的随机密码（即编码特定氨基酸的密码子数量相同）要高效得多。我们研究了逆问题，即密码结构如何影响保证遗传密码稳定性最高的氨基酸的物理化学参数的最优选择。结果表明，选择具有给定特性的两个或多个氨基酸可以唯一确定其他所有氨基酸。从这个意义上说，密码结构严格确定了氨基酸的最优参数。在具有标准遗传密码结构的密码中，通过“Leave One Out”方法和通过固定最大和最小参数的方法得到的疏水性的值与自然标度显著相关。这表明遗传密码和氨基酸的物理化学属性的共同进化。
作者：V. R. Chechetkin and V.V. Lobzin
论文ID：1210.4322
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2012-10-17