高通量全基因组关联分析用于单一和多个表型
摘要:基因组关联研究中使用的方差组分检验,在进行组学研究中分析多个特征时的计算负担变得很大。我们引入了两种高通量算法--CLAK-CHOL和CLAK-EIG--用于单个和多个表型的基因组关联研究(GWAS)。这些算法是通过专家系统帮助生成的,可以将计算复杂性降低到在普通工作站上几天内分析成千上万个特征与数百万个多态性的关联。通过利用问题特定的知识,CLAK-CHOL和CLAK-EIG在单个和多个特征分析中显著优于当前最先进的工具。
作者:Diego Fabregat-Traver (1), Yurii S. Aulchenko (2), Paolo Bientinesi (1), ((1) AICES, RWTH Aachen, (2) Institute of Cytology and Genetics SD RAS)
论文ID:1207.2169
分类:Computational Engineering, Finance, and Science
分类简称:cs.CE
提交时间:2012-11-13