多类型分支过程中后代分布的EM算法估计

摘要:多类型分支过程(MTBP)模拟分支结构,其中结果树的节点是不同类型的对象。生物学中这种模型的一个应用领域是细胞增殖研究。经常出现的一种采样方案是在离散时间点(有时只有一个时间点)观察几个独立的群落中的细胞数量。因此,这个过程在整个树的意义上是不可观察的,但可以观察到给定时刻的“代”的数量,其中包括每种类型的细胞数。这需要一种EM类型的算法来获得分支过程参数的最大似然(ML)估计。在终端类型的马尔可夫分支过程类中提供了一种计算方法来获取后代分布的估计。

作者:Nina Daskalova

论文ID:1206.3732

分类:Computation

分类简称:stat.CO

提交时间:2012-06-19

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