Entromics -- DNA中依赖序列碱基插入的热力学揭示了新颖的远程基因组组织
摘要：下一代测序中的零模波导技术展示了酶催化反应与基因组DNA的碱基合成之间的依赖关系。我们表明这些实验结果表明了DNA的一种未被表征的物理性质，即合成反应的化学势Δμ。我们使用图论和统计热力学的组合推导出熵力学模型Δμ的entromics。我们还展示了Δμi可以被量化地表征为合成熵。我们提出了从基因组DNA序列计算Δμ的公式。然后，我们从Δμ的热力学性质推导出对DNA性质和基因组装的重要限制。最后，我们展示了这些基因组装限制如何直接导致整个基因组中可检测的合成熵的演化。展示了表明功能和生物重要性的entromic应用示例。
作者：Petr Pancoska, Zdenek Moravek, Uday Kiran Para, Jaroslav Nesetril
论文ID：1206.2070
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2012-06-12