遗传反馈环的稳态波动：一种精确解
摘要：细胞中的遗传反馈环路打破了详细平衡，并涉及到双分子反应；因此，缺乏揭示这些环路中随机波动性质的精确解。我们在这里考虑基因调控反馈环路的主方程：一个基因产生蛋白质，然后蛋白质结合到同一基因的启动子并调控其表达。蛋白质自由态和结合态都会降解。该网络打破了详细平衡，涉及到单分子反应步骤。我们提供了对任意参数值的稳态主方程的精确解，并针对一些特殊情况提供了简化解。通过直接数值求解主方程，验证了分析的非平衡稳态概率分布的完全参数依赖性。对于结合态和自由态蛋白质降解速率相同的情况，我们的解与先前提出的精确解（Hornos et al, Phys. Rev. E {f 72}, 051907 (2005)及其后续研究）不一致。我们明确证明了这是由于那些研究中对基础主方程的非物理表述所致。
作者：R. Grima, D. R. Schmidt, T. J. Newman
论文ID：1206.1571
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2015-06-05