计算神经解剖学与基因表达：脑区域的最佳标记基因集合
摘要：基于成年小鼠大脑的三维数据驱动的Allen基因表达谱系图由数千个基因的数值化原位杂交数据组成，与Allen参考谱系图共同登记。我们提出了基于基因表达定位和功能拟合于该区域形状的定量标准，对基因进行排名，作为大脑区域的标记物。这些标准可以自然地推广到基因集合。我们发现，在大脑左半球的所有主要区域中，除了苍白球外，一些带有正负系数权重的基因集合几乎完美地定位。将该拟合标准推广到带有正性约束的情况下，可以稍微改善标记物，但需要更稀疏的基因集合。
作者：Pascal Grange and Partha P. Mitra
论文ID：1205.2721
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2012-05-15