酵母和植物根部中ZIP转运蛋白对锌摄取调控的建模
摘要：酵母(Saccharomyces cerevisiae)和植物根(Arabidopsis thaliana)中，锌通过ZIP家族的入流转运蛋白进入细胞。由于锌对细胞功能至关重要且在高浓度下具有毒性，紧密的调节对细胞的生存至关重要。我们从一个基于常微分方程的普遍模型出发，对酵母和植物根细胞的特定情况进行调整，提供了对其潜在机制的新见解。在酵母中，锌由转运蛋白ZRT1和ZRT2转运，并且都受锌响应转录因子ZAP1的调控。利用生物学数据，估计和分析了参数，验证了文献中ZRT1和ZRT2的不同亲和性。此外，我们的模型表明，ZAP1产生的正向反馈在高流入速率时具有稳定功能。在植物根中，多种ZIP转运蛋白参与锌的吸收。它们的调节机制主要不明，但认为bZIP转录因子可能参与其中。我们建立了三个假设模型：仅激活剂、激活剂与二聚化和激活剂/抑制剂。将其拟合到实测数据并进行分析。模拟结果显示，激活剂/抑制剂模型在合理的参数范围内提供了更为稳健和稳定的稳态。
作者：Juliane Claus and Andr''es Chavarr''ia-Krauser
论文ID：1202.4335
分类：Cell Behavior
分类简称：q-bio.CB
提交时间：2015-06-04