高阶染色质结构决定癌症中染色体改变的格局
摘要：癌症基因组结构信息的快速增长为更好理解癌症基因组变异的突变机制和对其产生作用的选择力提供了机会。在这里，我们测试了两个主要力量的证据，即空间染色体结构和净化（或负）选择，它们塑造了癌症中体细胞拷贝数变化（SCNA）的景观。使用最大似然框架，我们比较了SCNA图和通过全基因组染色体构象捕获（HiC）确定的三维基因组结构，这个结构由提出的分形球（FG）模型描述。本分析提供了证据，即癌症中染色体变化的分布与三维基因组结构有空间关联，并额外暗示在癌细胞体内的体细胞进化期间，除了正选择外，净化选择也塑造了SCNA的景观。
作者：Geoff Fudenberg, Gad Getz, Matthew Meyerson, Leonid Mirny
论文ID：1109.1321
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2011-09-08