细胞分化网络的结构要求和鉴别
摘要：干细胞分化的数学模型通常基于细胞命运决策概念，每个决策由基因调控网络控制。这些网络呈多态行为，并导致系统在定性上切换到不同的稳定态。然而，这种切换模块的网络结构通常是不确定的，并且对于确切的反应动力学缺乏了解。因此，本文对由三个相互作用的转录调节因子负责细胞分化的小网络进行了基础研究：我们研究了哪些网络结构可以重现特定的多态行为，以及每个网络实现这种行为的稳定性。为了解决这些问题，我们使用了一个建模框架，该框架仅使用关于网络的定性信息，但可以区分模型，并评估所需的多态性特性的稳健性。我们揭示了实现细胞分化所需的不同稳态模式的结构性网络特性。我们的结果还表明，网络的结构和稳健性特性是相互关联的。
作者：Christian Breindl, Daniella Schittler, Steffen Waldherr, Frank Allg"ower
论文ID：1107.0900
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2011-07-06