系统生物学中的随机建模
摘要：基因调控网络的动力学是系统生物学研究的主要内容之一，许多细胞行为都受到基因调控网络的调控。由于这些反应系统中的分子数量较少，随机效应非常显著。近年来，随机性在基因调控网络动力学建模中引起了许多研究者的关注。本论文是一篇自成体系的综述，旨在概述随机建模的方法。作者将介绍用于建模具有内在噪声的生化系统的主要方程的推导（化学主方程，福克-普朗克方程，反应速率方程，化学朗之万方程），并讨论这些表达式之间的关系。还将讨论具有动力学参数波动的系统的数学表述。最后，作者将介绍精确随机模拟算法和近似显式tau跳跃方法，以进行数值模拟。
作者：Jinzhi Lei
论文ID：1104.4524
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2011-04-26