PAMAM6树状聚合物和DNA：小角X射线散射揭示的pH依赖性“串珠”行为
摘要：DNA与多阳离子的相互作用不仅对我们理解染色质的紧缩非常重要，而且还有助于表征参与转录、复制和修复的DNA结合蛋白质。已知DNA会根据多阳离子的结构和电荷密度等因素形成几种液晶相。理论研究和模拟预测了DNA围绕球形正电聚阳离子的包裹。作为组蛋白八聚体或其他DNA包裹蛋白的潜在模拟物，我们选择了聚（酰胺胺）第6代（PAMAM6）树状聚合物进行研究。我们利用小角X射线散射（SAXS）研究了PAMAM6诱导的DNA自组装，以揭示其结构与环境pH值和树状聚合物浓度的依赖关系。我们证明，在pH值为8.5时形成了密集相，并具有2D柱状六角晶格的特征，随着树状聚合物浓度（N/P电荷比）的增加，该结构转变为3D六角晶格。此外，我们对pH值为8.5和5.5的稀释样品收集的散射数据进行了系统分析，提出了DNA在pH值为5.5时围绕PAMAM6进行包裹的一种情景。
作者：Rolf Dootz, Adriana Cristina Toma and Thomas Pfohl
论文ID：1104.2216
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2011-04-13