傅立叶变换离子回旋共振质谱法区分分子结扣的拓扑异构体:来自II类套索肽的启示
摘要:Lasso肽是一类具有结构缠绕的生物活性肽,其中肽的C端尾部穿过并被困在N端的大环内。对lasso结构的结构表征和与其非缠绕异构体的区分并不容易,通常需要使用互补的生化和光谱方法。本研究中,我们研究了两种属于II类lasso肽家族的抗菌肽及其相应的非缠绕异构体:Microcin J25(MccJ25),已知在碰撞诱导解离(CID)下可产生专属于lasso结构的两肽离子产品;Capistruin,CID无法明确分配lasso结构。这两对异构体通过电喷雾离子化傅立叶变换离子回旋共振质谱法(ESI-FTICR MS)进行了分析,包括CID、红外多光子解离(IRMPD)和电子捕获解离(ECD)。CID和ECD光谱清晰地区分了MccJ25和其非lasso异构体MccJ25-lcm,而对于Capistruin,只有ECD有信息,并显示出不同程度的氢迁移(从c/z到c z/Link text)对于缠绕和非缠绕异构体而言。Triply-charged MccJ25和MccJ25-lcm的ECD光谱显示出一系列的基性b型产物离子{eth}b0In{TH}。我们提出这些离子是环状分支肽的特异性并且来自环和尾部的双重c/z和y/b解离。这项研究显示了ECD在结构表征肽异构体方面的潜力,以及构象对电子俘获后氢迁移的影响。
作者:S''everine Zirah, Carlos Afonso (IPCM), Uwe Linne, Thomas A Knappe, Mohamed A Marahiel, Sylvie Rebuffat, Jean-Claude Tabet (IPCM)
论文ID:1103.3883
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2011-03-22