染色质相互作用在增强子和绝缘体的长程调控作用中的理论分析
摘要：增强子与其目标基因之间的长距离调控相互作用在高等真核生物中很常见。中间的边界或绝缘体可以阻断这些长距离调控相互作用。绝缘体活性的机制基础及其与增强子远程作用之间的关系仍不清楚。在本研究中，我们探讨了拓扑环可以同时解释远程增强子的调控作用和边界元素的绝缘活性的想法。我们展示了，虽然仅仅形成环形本身无法解释远程作用，但是将染色质纤维之间的短暂非特异性和适度引力相互作用融入其中，强烈增强了远程调控相互作用，并足以产生类似真核染色质的状态。在相同条件下，通过绝缘体将环分成两个拓扑独立的环抑制了域间相互作用。这种效应的潜在原因是在中等距离的接触图中抑制了交错。因此，我们的模型同时解释了远程调控作用和边界元素的绝缘活性。这个统一的染色质环调控模型提出了一些可供“体外”实验、基因组染色质构象捕获和荧光显微技术检验的可测试预测。
作者：Swagatam Mukhopadhyay, Paul D. Schedl, Vasily M. Studitsky and Anirvan M. Sengupta
论文ID：1103.2834
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2015-05-27