Saccharomyces cerevisiae启动子区域的分类揭示了核小体缺失的转录因子占据的热点存在
摘要：预测转录因子在基因组上的占位模式是一个重大挑战，本文通过对138个转录因子的ChIP-chip数据重新分析，在酵母中将上游启动子区域划分为15种不同的染色质类型，其中包括5％的启动子通过这种独特方式高度被(基本上)富含培养基中的所有转录因子占据。这些转录因子的占位热点在核小体中严重缺失，并且更倾向于被染色质重塑复合物和复制起源复合物(ORC)选择。此外，它们是唯一富含Rap1p和Pdr1p结合位点的染色质类型，我们发现这些位点与已知影响局部DNA结构的AAA/TTT序列合作，以减少核小体的占位。综上所述，我们的结果揭示并表征了酵母中的一种新型局部染色质结构。
作者：Junbai Wang, Lucas D. Ward, and Harmen J. Bussemaker
论文ID：1010.0713
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2011-06-03