人类和小鼠基因组中可转座元件外显化特征
摘要：译文：转座元件插入到哺乳动物基因中被认为是哺乳动物进化和物种形成的重要贡献者。将转座元件插入到内含子中可导致它们被激活为替代剪接孔氏外显子，这一事件被称为外显子化。阐明塑造人类和小鼠蛋白编码基因内转座元件固定及随后外显子化的进化约束对于理解外显子化过程如何影响转录组和蛋白质组复杂性非常重要。在这里，我们展示了转座元件的外显子化在人类和小鼠基因中偏向于编码序列的开始部分。单核苷酸多态性（SNP）分析揭示了转座元件的外显子化可能是特定于人群的，这意味着外显子化可能增强差异并导致物种形成。SNP密度分析揭示了Alu和其他转座元件之间的差异。最后，我们确定了依赖RNA编辑的灵长类特异性Alu元件外显子化的情况。这些结果揭示了在人类和小鼠基因内转座元件固定和外显子化过程中的一些信息。
作者：Noa Sela, Britta Mersch, Agnes Hotz-Wagenblatt, Gil Ast
论文ID：1006.3172
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2010-06-17