NTRFINDER：一个用于寻找嵌套串联重复序列的软件工具
摘要：使用软件工具NTRFinder来寻找DNA中的复杂重复结构，我们称之为嵌套串联重复（NTR）。NTR是两个或更多不同的串联基序交替出现的重复。我们认为嵌套串联重复可以用作系统发育和种群标记物。我们在真实和模拟数据上测试了我们的算法，并展示了一些有趣的真实嵌套串联重复。我们讨论了在芋头（芋属植物）的核糖体DNA中发现的NTR如何帮助确定这种古老的主食作物的栽培史。NTRFinder可以从http://www.maths.otago.ac.nz/? aamatroud/下载。
作者：A. A. Matroud, M. D. Hendy and C. P. Tuffley
论文ID：1006.1730
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2011-05-04