蛋白质体系中螺旋-卷曲-折叠转变的可精确求解模型
摘要：螺旋-β折叠转变在蛋白质聚集中的重要作用下，我们引入了一个简单的模型来研究螺旋-卷曲-β折叠系统的二级结构转变，该模型使用一个以有效哈密顿量为起点的Potts模型。该能量函数依赖于四个参数，这些参数大致描述了多肽在螺旋和β折叠构象的稳定性中的熵和焓的贡献。β折叠结构涉及远序列的残基之间的长程相互作用，但在实空间中相互接触。这些接触被包括在哈密顿量中。使用标准的统计力学技术，通过传递矩阵精确求解了分配函数。基于这个模型，我们研究了多肽的热力学性质，包括螺旋、β折叠和卷曲结构之间的相变。
作者：John S. Schreck and Jian-Min Yuan
论文ID：1005.4919
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2011-11-09