RNAse酶的自组装任意形状:用小尺度因子达到科尔莫哥洛夫界限(扩展摘要)

摘要:算法自组装模型,以SODA 2010中研究的正方形王砖为基础。模型中有两种类型的砖块(例如,由DNA和RNA物质构建),以及一个销毁特定类型砖块的操作(例如,RNA酶销毁所有的RNA砖块)。我们证明,使用一次销毁操作可以更高效地构建任意形状。特别地,通过仅对形状进行对数比例的缩放,就可以使用渐近最优数量的不同砖块类型(与形状的科尔莫哥洛夫复杂度相关)来构建任意形状。相比之下,在没有销毁操作的情况下,最好的结果的比例因子至少是形状大小的线性倍数,并且只能通过缩放后的砖块的生成树来连接。我们还描述了一个大型的形状集合,可以在没有任何缩放的情况下高效构建。

作者:Erik D. Demaine, Matthew J. Patitz, Robert T. Schweller, Scott M. Summers

论文ID:1004.4383

分类:Computational Complexity

分类简称:cs.CC

提交时间:2010-07-09

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